Preview

Медицинский вестник Башкортостана

Расширенный поиск

ПРИМЕНЕНИЕ КЛАСТЕРНОГО АНАЛИЗА ПРИ ФОРМИРОВАНИИ ФЕНОТИПОВ ПЕРВИЧНОЙ ОТКРЫТОУГОЛЬНОЙ ГЛАУКОМЫ

Аннотация

Цель исследования - изучение эффективности применения иерархического кластерного анализа для формирования фенотипов первичной открытоугольной глаукомы.Материал и методы. Кластерный анализ был применен для обработки стандартизированного набора клинико-генетических показателей у 348 пациентов (696 глаз) в возрасте от 45 до 87 лет (в среднем 61,28±10,13) с различными стадиями первичной открытоугольной глаукомы (ПОУГ).Результаты. По итогам многофакторного анализа были выявлены параметры, которые играют важную роль в разделении выборки пациентов с ПОУГ на клинические фенотипы. С целью определения возможных фенотипов больных осуществили кластеризацию по методу Варда с формированием древовидной диаграммы и определением четырех кластеров.Методом k-средних Мак-Квина получены структуры кластеров (фенотипов) пациентов ПОУГ с высоким процентом(96,8%) правильности оценки группировки исходных наблюдений.Выводы. 1. Показана высокая эффективность применения иерархического кластерного анализа при формировании фенотипов ПОУГ. 2. На основе исследования качественных и количественных анамнестических, клинико-функциональных, морфометрических и генетических параметров у пациентов сформированы четыре клинических фенотипа первичной открытоугольной глаукомы.

Об авторах

А. Ш. Загидуллина
ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет» Минздрава России
Россия


Б. М. Азнабаев
ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет» Минздрава России
Россия


Р. Х. Зулкарнеев
ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет» Минздрава России
Россия


А. И. Арсланова
ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет» Минздрава России; ГБУЗ РБ «Городская клиническая больница №8»
Россия


С. Р. Авхадеева
ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет» Минздрава России
Россия


Список литературы

1. Берестнева, О.Г. Методы исследования структуры медицинских данных / О.Г. Берестнева, И.А. Осадчая, Е.В. Немеров // Векторы благополучия: экономика и социум. - 2012. - Т. 1, № 2. - С. 333-338

2. Cluster analysis in Nursing Research: an introduction, historical perspective, and future directions / H. Dunn [et al.] // West J. Nurs. Res. - 2018. - Vol. 40, № 11. - P. 1658-1676

3. Ненашева, Н.М. Фенотипы бронхиальной астмы и выбор терапии / Н.М. Ненашева // Практическая пульмонология. - 2014. - № 2. - С. 2-11

4. Радиационно-эпидемиологическая классификация заболеваемости и смертности ликвидаторов от цереброваскулярных заболеваний методами кластерного анализа и главных компонент / В.К. Иванов [и др.] // Радиация и риск. - 2014. - № 4. - С. 8-21

5. Alshahrani, M. Semantic Disease Gene Embeddings (SmuDGE): phenotype-based disease gene prioritization without phenotypes / M. Alshahrani, R. Hoehndorf // Bioinformatics. - 2018. - Vol. 34, № 17. - P. 901-907

6. A data mining metabolomics exploration of glaucoma /j. Kouassi Nzoughet [et al.] // Metabolites. - 2020. - Vol. 10, № 2. - P. 49

7. Differential metabolic markers associated with primary open-angle glaucoma and cataract in human aqueous humor / C.W. Pan [et al.] // BMC Ophthalmol. - 2020. - Vol. 20, № 1. - P. 183

8. Ocular hypertension treatment study group. The ocular hypertension treatment study: baseline factors that predict the onset of primary open-angle glaucoma / M.O. Gordon [et al.] // Arch. Ophthalmol. - 2002. - Vol. 120, № 6. - P. 714-720

9. Predictors of long-term progression in the early manifest glaucoma trial / M.C. Leske [et al.] // Ophthalmology. - 2007. - Vol. 114, № 11. - P. 1965-1972

10. The path to open-angle glaucoma gene discovery: endophenotypic status of intraocular pressure, cup-to-disc ratio, and central corneal thickness /j. Charlesworth [et al.] // Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. - 2010. - Vol. 51, № 7. - P. 3509-3514

11. Gardiner, S.K. Detection of functional deterioration in glaucoma by trend analysis using comprehensive overlapping clusters of locations / S.K. Gardiner, S.L. Mansberger // Sci. Rep. - 2020. - Vol. 10, № 1. - P. 18470

12. Torres, L.A. Correlating structural and functional damage in glaucoma / L.A. Torres, M. Hatanaka //j. Glaucoma. - 2019. - Vol. 28, № 12. - P. 1079-1085


Рецензия

Для цитирования:


Загидуллина А.Ш., Азнабаев Б.М., Зулкарнеев Р.Х., Арсланова А.И., Авхадеева С.Р. ПРИМЕНЕНИЕ КЛАСТЕРНОГО АНАЛИЗА ПРИ ФОРМИРОВАНИИ ФЕНОТИПОВ ПЕРВИЧНОЙ ОТКРЫТОУГОЛЬНОЙ ГЛАУКОМЫ. Медицинский вестник Башкортостана. 2022;17(4):5-9.

For citation:


Zagidullina A.Sh., Aznabaev B.M., Zulkarneev R.Kh., Arslanova A.I., Avkhadeeva S.R. APPLICATION OF CLUSTER ANALYSIS IN THE FORMATION OF PRIMARY OPEN-ANGLE GLAUCOMA PHENOTYPES. Bashkortostan Medical Journal. 2022;17(4):5-9. (In Russ.)

Просмотров: 49


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1999-6209 (Print)